剧情：有一天，冲绳海域出现了一个奇怪的生物。让人联想到荆棘冠海星，“它”用毒液伤害了渔民，并迅速蔓延到整个日本。这是怪物达加拉复活的前兆，达加拉是由传说中的NiraiKanai的古代文明创造的，作为解决环境污染的生物净化系统，但由于它的失控，这导致了NiraiKanai的破坏。　　察觉到地球的危险，伊莱亚斯姐妹飞到了石垣岛，那里出现了来自新井金井的小生物Gogo，还有来自大陆的偷猎者意识到它尾巴上的装饰环有宝藏，还有保护Gogo的当地女孩。伊莱亚斯修女知道传说，在尼莱金井的废墟中有一个宝藏可以打败达加拉。女孩们，伊莱亚斯姐妹，黑仙柏培拉和偷猎者，谁与姐妹们不和，组队出海。

魔斯拉海底大战的剧情紧跟在第一部之后，就连伺候魔斯拉的小妖精和黑暗妖精的演员也没有换人。但是这次本作走的是异域的风格。原创了一个类似于亚特兰蒂斯的海上文明，以及魔兽达哥拉。

依旧是比较低龄向的剧情，但是在描述小朋友之间的对立或者友情方面，比较有趣。有点藤子不二雄机器猫的味道。而特技和特摄的效果，也基本上达到了那个时代的尖端水平。

本作的一个问题是剧情进展实在有点缓慢，几个小朋友进到海上城堡的时候，影片时间就已经过去了很大一部分，之前一直在不厌其烦的介绍孩子，介绍孩子和他的家人邻居，介绍跑出来的那个毛茸茸的怪物，还有魔斯拉小妖精和黑暗妖精。

本片的主要看点还是达哥拉和魔斯拉的对决。在我看来，达哥拉是目前为止我看到的最为阴险狡诈，善于利用自己的优势进行打斗的怪兽，其技能也是相当的阴损。面对魔斯拉的璘粉攻击，以及光波攻击，他躲在海底就可以减弱其一半以上的威力，进而利用自己的寄生飞镖，搞定一鼓作气的哥斯拉。整个战斗中，达哥拉的策略非常正确，就是潜入海底和魔斯拉进行周旋，而魔斯拉只会在海面上无异议的攻击，没有什么有效的策略引诱达哥拉出海。如果不是最后魔斯拉开了外挂暴走，结果可能真就崴泥了。

相对独立一点的故事，世界观什么的，都没有很好的延展，在我看来本作唯一能看的就是达哥拉，魔斯拉真的太弱了，包括后来的水中战斗模式，有点主创强加给他胜利剧情的味道。。。