剧情：三剑客成功拯救完水果世界后，由于在花果山大合唱庆祝胜利造成第七层的崩塌，直接伤害到七色彩莲。为求保住彩莲，东方求败被外人蛊惑利用，接受了人类世界的忍术和其他技术去抢救彩莲，但同时也成为了拐带水果们的帮凶。方丈与果姥上山探望东方求败，无意间看出当中端倪，东方求败有灭口之意。三剑客赶到之时，方丈与果姥为保存实力，不单一个装疯扮傻，一个诈死，还出狠招将三剑客打落悬崖，并且疯言疯语，让众人误会三剑客，促使三剑客再无立足之地，必须远走他乡，从而避开东方求败的迫害。　　三剑客在小果叮的帮助下捡回一命，重拾斗志誓要查出真相。在小果叮的指示下，各人各尽所长，千方百计寻找莲珠。历经重重苦难，并的机甲在莲珠的洗礼下得到重生，三人不断提升自我，获得新的技能和必杀技，对方也得到力量加强和武器升级，尤其是加上神鬼莫测的忍术，三人多次陷入苦战。三剑客屡败屡战，在失败中成长，反败为胜。女特攻们同样自强不息，一样创出新的招数和技能必杀，来支援三剑客。众人在花果山汇合，迎来与东方求败的终极一战。几经艰辛终于获得胜利，但东方求败的失败并不意味事情结束。　　果宝们几经艰辛，终于来到第七层。真正的幕后黑手是外来人类龟太公。单凭众人之力并不足以抗衡。这时，养精蓄锐的老特攻们及时出手，2代特攻通力合作与龟太公周旋。这正正便是方丈和果佬计划好的联合作战计划。在敌我实力悬殊下，众果宝特攻突破自我，进化成黄金7合体，与龟太公决一死战。

1 开学第一天 2 忍者学院 3 无敌忍术 4 六月飞霜 5 嫁接喷剂 6 爱心莲珠 7 智慧莲珠 8 正义莲珠 9 再回花果山 10 大战魔动王 11 飞刃破岩爪 12 小果战宝升级 13 冰天雪地 14 围困冰镇 15 再战海鲨王 16 菠萝战宝升级 17 磁铁阵 18 夺命追魂鬼旋镖 19 核电危机 20 香橙战宝升级 21 绿洲陷阱 22 小果叮的绝唱 23 全军覆没 24 奇迹三合体 25 力破巨炮城 26 天诛地灭 27 惊天大阴谋 28 绝望摩星岭 29 再上征途 30 怒火豪情 31 冰海漩涡 32 烈女菇云 33 黄沙狂舞 34 果宝翼神 35 火龙对决 36 鸳鸯蝴蝶炮 37 零食部落 38 金蛋重生 39 勇者归来 40 命运奇缘 41 再见小薇 42 神机侠侣 43 孝义两难全 44 奇兵闹法场 45 七剑归一 46 天翻地覆 47 果元天尊 48 对薄公堂 49 忍者龟太公 50 花果山保卫战 51 黄金七合体 52 果宝无敌